主要危害叶和花梗，贮藏期也可侵染鳞茎。叶片和花梗上的病斑初呈水渍状白色小点，多靠近叶尖或位于花梗中部，稍显凹陷，后逐渐扩大，大小为2～4cm×1～3cm，紫褐色，椭圆形，周围有黄色晕圈，有明显的同心轮纹，潮湿时病斑上生有紫霉层。病斑可相互愈合形成大斑，病部组织死亡失水而使机械强度降低，常使叶或花梗从此处折断，如果是留种株，花梗折断常使留种失败，或使种子皱瘪不能充分成熟。鳞茎发病，呈半湿性腐烂，整个鳞茎体积收缩，组织变红色或黄色，渐转变成暗褐色，并提前抽芽。和大葱黑斑病不同的是霉层紫色，而黑斑病霉层黑色。