病初在叶缘和叶脉间出现不规则形淡黄色斑块，病斑逐渐扩大，从病斑边缘至中心的颜色逐渐加深，而靠近主脉处仍保持绿色，呈“褐色掌状斑驳”，随后变色部位的叶缘和斑驳组织逐渐枯焦，呈现“花西瓜皮”症状。发病严重时，整张叶片枯焦破碎，只留叶脉呈鸡爪状叶痕，后期叶片萎蔫、下垂、脱落成光秆。棉花黄萎病、棉花枯萎病都引致维管束变色。棉花黄萎病变色较浅，多呈黄褐色；枯萎病颜色较深，多呈黑褐色或黑色。发病重的棉株茎秆、枝条、叶柄的维管束全都变色。